雞糞是全台農業最主要的肥料來源，但約八成生雞糞直接下田，傷害土壤、作物與環境。過往稽查雞糞是否腐熟，僅能以含水率判定不準確，若要準確則需送實驗室，但須等待一個月。畜試所和臺大農化系合作，以「可見-近紅外光譜儀」 (Vis-NIR) 掃描，只要 2 秒就可知道雞糞是否完全腐熟，目前判定的準確率已達 85%。
全台生雞糞八成直接下田，危害作物、土壤、環境
雞糞為有機質肥料的原料，若未經充分醱酵、乾燥加工，則稱為「生雞糞」。農業部統計，2021年全台化學肥料施用量為79萬公噸，有機質肥料施用量為26萬公噸，合計105萬公噸。而同年生雞糞產量是217萬公噸，其中有 76%、164.92 萬公噸不當施用於田間，遠超過合法的肥料。
生雞糞因肥效強、價格低廉，且購買方便，甚至可以一通電話找代施肥，因此任何果樹、菜園、茶園、檳榔園等田區都會使用生雞糞，然而，長期施用生雞糞，將造成許多問題。
台灣大學農業化學系特聘教授許正一說明，有機質肥料有一定碳氮比，生雞糞的氮素含量高，進入田間會造成物質不穩定、土壤不平衡，而尚未腐熟，施用於田間仍會持續醱酵，醱酵過程溫度升高，導致作物燒根、引發病蟲害，且生雞糞的異味、帶來的病原菌及蟲卵，亦會造成環境衛生問題。
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