對於吹哨者所提及赴日交流之差旅費用，輔大指出，相關行政作業一向須嚴格遵循政府法規及校內審計程序辦理，並無例外。依現行規定，所有計畫經費之撥付，必須建立在「專案經核定通過」且「支出發生於計畫執行期間」的前提之下。
針對與筑波大學之交流計畫，校方研發處曾多次函請相關團隊於期限內補齊計畫書，以完成必要行政程序，惟該團隊遲遲未在期限內依規定辦理。經學審會委員充分討論後，最終決議撤銷該案，校方依法「實無從撥付補助款」。
對於投訴內容中另暗指校長出訪係為「逃避校內紛爭」，輔大則嚴正澄清，此一說法顯屬無稽。
校方指出，國際學術交流與訪問行程皆須提前數月進行規劃，絕非臨時起意，更不存在刻意迴避之情事。面對高教少子化所帶來的嚴峻挑戰，校長親自率團赴海外拓展生源、爭取資源並簽署具體合作協議，正是基於校務永續發展的責任與實際作為。
輔大強調，將既定公務行程刻意曲解為逃避行為，不僅背離事實，也抹煞行政團隊為學校開拓資源所付出的努力。該校正值創校百周年的重要歷史時刻，全校教職員工皆戮力同心，為學校長遠發展共同打拚。
針對外界所流傳的「內鬥」或「派系糾紛」等說法，校方嚴正澄清均屬不實指控，呼籲外界勿隨之起舞。
